На сегодняшний день экология является сложной интегративной наукой, затрагивающей различные области знаний.

Обучение по направлению "химия окружающей среды" ведут специалисты различных областей науки, что и определяет "уникальность" Кафедры химии окружающей среды ФЕН.:

Только совместными усилиями можно подготовить полноценные кадры химиков-экологов.

Обучение по направлению "Фармакохимия биологически активных веществ" является более узкоспециализированным и ведётся специалистами в области фармацевтических наук, органической химии, медицинской химии, молекулярной биологии, биохимии и др.

Кафедра химии окружающей среды была открыта в 1992 г. для подготовки специалистов в области экологической химии. С 1992 по 2000 г. осуществлялся прием на специальность "экология и природопользование". Под руководством Николая Михайловича Бажина - известного ученого, специалиста в области физической химии, химии атмосферы, фотохимии был создан уникальный учебный план, сочетавший полноценную подготовку в области химии с изучением комплекса биологических дисциплин, получением основ знаний по экогеохимии, природоохранному законодательству, основам экономики природопользования и т.д. Такая универсальная подготовка создавала хорошие предпосылки для работы на стыке химии, биологии, геологии, где в настоящее время возникает много новых научных направлений. По мнению самих студентов, они получали элитное образование, которое делало их в высшей степени конкурентноспособными не только в науке, но и в других сферах деятельности, традиционных для выпускников НГУ. Обучение на кафедре впервые на факультете осуществлялось по схеме "бакалавриат-магистратура". Первый выпуск бакалавров по специальности "экология" состоялся в 1996 году, последний - в 2004 г. После бакалавриата выпускники обучались в магистратуре по разным направлениям химического отделения ФЕН и в дальнейшем более чем в 90 % случаев продолжили занятия наукой (самый высокий процент среди всех специальностей НГУ). Большинство экологов успешно защитили кандидатские диссертации. В трудные 90-е многие из них уехали за границу и успешно продолжили занятия наукой в университетах и научных центрах Европы. Некоторые предпочли фармацевтические фирмы или фирмы, решающие экологические проблемы (например, актуальные во всем мире проблемы обезвреживания и утилизации отходов, устранения нефтяных загрязнений и т.п.), т.е. сочетание науки и менеджмента.

С 2001 года набор на специальность прекращен. На кафедре создана специализация "химия окружающей среды" для бакалавров и специалистов химического отделения ФЕН, параллельно ведется обучение по магистерской программе "Химия окружающей среды, химическая экспертиза и экологическая безопасность".

В 2016 году на кафедре введена магистерская программа "Фармакохимия биологически активных веществ".

В Сибирском отделении РАН нет института химической экологии (как нет, например, и института аналитической химии).

Базовым для кафедры по направлению подготовки "Химия окружающей среды" является Институт неорганической химии СО РАН. Однако, кафедра химии окружающей среды активно сотрудничает с целым рядом институтов СО РАН и СО РАМН, поскольку в них есть экологические лаборатории и представлены экологические направления исследований, органично встроенные в научную тематику институтов. В каждом из этих институтов исследователи работают над решением экологических проблем, используя подходы, типичные для данной области науки.

На протяжении последних 20 лет студенты кафедры успешно выполняют выпускные квалификационные работы в этих лабораториях, а также в лабораториях других институтов: Института катализа СО РАН (Группа фотокатализа на полупроводниках и др.), Новосибирский институт органической химии СО РАН (лаборатория экологических исследований и хроматографического анализа), Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Центра вирусологии и биотехнологии "Вектор" и др.

Базовым для кафедры по направлению подготовки "Фармакохимия биологически активных веществ" является Новосибирский институт органической химии СО РАН, а также ряд биологических и медицинских институтов.